Huszár, Krisztina ; Welker, Zsombor ; Györgypál, Zoltán ; Tóth, Eszter ; Ligeti, Zoltán ; Kulcsár, Péter István ; Dancsó, János ; Tálas, András ; Krausz, Sarah Laura ; Varga, Éva ; Welker Ervin
Position-dependent sequence motif preferences of SpCas9 are largely determined by scaffold-complementary spacer motifs
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 51 : 11 pp. 5847-5863. , 17 p. (2023)
DOI   WoS    REAL   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Kulcsár, Péter István ; Tálas, András ; Ligeti, Zoltán ; Tóth, Eszter ; Rakvács, Zsófia ; Bartos, Zsuzsanna ; Krausz, Sharah Laura ; Welker, Ágnes ; Végi, Vanessza Laura ; Huszár, Krisztina ; Welker Ervin
A cleavage rule for selection of increased-fidelity SpCas9 variants with high efficiency and no detectable off-targets
NATURE COMMUNICATIONS 14 : 1 Paper: 5746 , 20 p. (2023)
DOI   WoS   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Kulcsár, Péter István ; Tálas, András ; Ligeti, Zoltán ; Krausz, Sarah Laura ; Welker, Ervin 
SuperFi-Cas9 exhibits remarkable fidelity but severely reduced activity yet works effectively with ABE8e
NATURE COMMUNICATIONS 13 : 1 Paper: 6858 , 11 p. (2022)
DOI   WoS    REAL   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Simon, Dorottya Anna ; Tálas, András ; Kulcsár, Péter István ; Biczók, Zsuzsanna ; Krausz, Sarah Laura ; Várady, György ; Welker, Ervin
PEAR, a flexible fluorescent reporter for the identification and enrichment of successfully prime edited cells
ELIFE 11 Paper: e69504 , 19 p. (2022)
DOI   WoS    REAL   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Tálas, András ; Simon, Dorottya Anna ; Kulcsár, Péter István ; Varga, Éva ; Krausz, Sarah Laura ; Welker, Ervin
BEAR reveals that increased fidelity variants can successfully reduce the mismatch tolerance of adenine but not cytosine base editors
NATURE COMMUNICATIONS 12 : 1 Paper: 6353 , 14 p. (2021)
DOI   WoS    REAL   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Tálas, András ; Huszár, Krisztina ; Kulcsár, Péter István ; Varga, Julia K ; Varga, Éva ; Tóth, Eszter ; Welker, Zsombor ; Erdős, Gergely ; Pach, Péter Ferenc ; Welker, Ágnes ; Györgypál, Zoltán ; Tusnády, Gábor ; Welker, Ervin 
A method for characterizing Cas9 variants via a one-million target sequence library of self-targeting sgRNAs
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 49 : 6 Paper: e31 , 12 p. (2021)
DOI   WoS    REAL   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Kulcsár, Péter István ; Tálas, András ; Tóth, Eszter ; Nyeste, Antal ; Ligeti, Zoltán ; Welker, Zsombor ; Welker, Ervin
Blackjack mutations improve the on-target activities of increased fidelity variants of SpCas9 with 5′G-extended sgRNAs
NATURE COMMUNICATIONS 11 : 1 Paper: 1223 , 14 p. (2020)
DOI    REAL   WoS   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Tóth, Eszter ; Varga, Éva ; Kulcsár, Péter István ; Kocsis-Jutka, Virág ; Krausz, Sarah Laura ; Nyeste, Antal ; Welker, Zsombor ; Huszár, Krisztina ; Ligeti, Zoltán ; Tálas, András ; Welker, Ervin
Improved LbCas12a variants with altered PAM specificities further broaden the genome targeting range of Cas12a nucleases
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 48 : 7 pp. 3722-3733. , 12 p. (2020)
DOI    REAL   WoS   Scopus   PubMed   Other URL
Article (Journal Article)

Tóth, Eszter ; Czene, Bernadett C ; Kulcsár, Péter István ; Krausz, Sarah Laura ; Tálas, András ; Nyeste, Antal ; Varga, Éva ; Huszár, Krisztina ; Weinhardt, Nóra ; Ligeti, Zoltán ; Borsy, Adrienn Éva ; Fodor, Elfrieda ; Welker, Ervin
Mb- and FnCpf1 nucleases are active in mammalian cells: activities and PAM preferences of four wild-type Cpf1 nucleases and of their altered PAM specificity variants
NUCLEIC ACIDS RESEARCH 46 : 19 pp. 10272-10285. , 14 p. (2018)
DOI    REAL   WoS   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Kulcsár, Péter István ; Tálas, András ; Huszár, Krisztina ; Ligeti, Zoltán ; Toth, Eszter; Weinhardt, Nóra ; Fodor, Elfrieda ; Welker, Ervin
Crossing enhanced and high fidelity SpCas9 nucleases to optimize specificity and cleavage
GENOME BIOLOGY 18 Paper: 190 , 17 p. (2017)
DOI    REAL   WoS   Scopus   PubMed    SZTE Publicatio
Article (Journal Article)

Tálas, András ; Kulcsár, Péter István ; Weinhardt, Nóra ; Borsy, Adrienn ; Tóth, Eszter ; Szebényi, Kornélia ; Krausz, Sarah Laura ; Huszár, Krisztina ; Vida, István ; Sturm, Ádám ; Gordos, Bianka ; Hoffmann, Orsolya Ivett ; Bencsura, Petra ; Nyeste, Antal ; Ligeti, Zoltán ; Fodor, Elfrieda ; Welker, Ervin
A convenient method to pre-screen candidate guide RNAs for CRISPR/Cas9 gene editing by NHEJ-mediated integration of a ‘self-cleaving’ GFP-expression plasmid
DNA RESEARCH 24 : 6 pp. 609-621. , 13 p. (2017)
DOI    REAL   WoS    EDIT   Scopus   PubMed    SZTE Publicatio
Article (Journal Article)

Tóth, Eszter ; Weinhardt, Nóra ; Bencsura, Petra ; Huszár, Krisztina ; Kulcsár, Péter István ; Tálas, András ; Fodor, Elfrieda ; Welker, Ervin
Cpf1 nucleases demonstrate robust activity to induce DNA modification by exploiting homology directed repair pathways in mammalian cells
BIOLOGY DIRECT 11 Paper: 46 , 14 p. (2016)
DOI    REAL   WoS   Scopus   PubMed    SZTE Publicatio
Article (Journal Article)

Tóth, Eszter ; Huszár, Krisztina ; Bencsura, Petra ; Kulcsár, Péter István ; Vodicska, Barbara ; Nyeste, Antal ; Welker, Zsombor ; Tóth, Szilvia ; Welker, Ervin
Restriction enzyme body doubles and PCR cloning: on the general use of type IIs restriction enzymes for cloning.
PLOS ONE 9 : 3 Paper: e90896 , 12 p. (2014)
DOI   WoS   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)

Tóth, Eszter ; Kulcsár, Péter István ; Fodor, Elfrieda ; Ayaydin, Ferhan ; Kalmár, Lajos ; Borsy, Adrienn Éva ; Laszlo, Lajos ; Welker, Ervin
The highly conserved, N-terminal (RXXX)8 motif of mouse Shadoo mediates nuclear accumulation.
BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA-MOLECULAR CELL RESEARCH 1833 : 5 pp. 1199-1211. , 13 p. (2013)
DOI   REAL   WoS   Scopus   PubMed
Article (Journal Article)